Protein–RNA interactions for Protein: O88623

Usp2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp2O88623 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp2O88623 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp2O88623 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp2O88623 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp2O88623 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp2O88623 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp2O88623 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp2O88623 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp2O88623 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp2O88623 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp2O88623 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp2O88623 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp2O88623 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms