Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms