Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3aO70157 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3aO70157 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Top3aO70157 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top3aO70157 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top3aO70157 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top3aO70157 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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Top3aO70157 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top3aO70157 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3aO70157 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3aO70157 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3aO70157 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Top3aO70157 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms