Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl35aO55142 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms