Protein–RNA interactions for Protein: O55131

Sept7, Septin-7, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept7O55131 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sept7O55131 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sept7O55131 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sept7O55131 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sept7O55131 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sept7O55131 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sept7O55131 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sept7O55131 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sept7O55131 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sept7O55131 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sept7O55131 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms