Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms