Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Gm14975-201ENSMUST00000118741 664 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 2310040G07Rik-202ENSMUST00000145897 462 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Vmn1r2-202ENSMUST00000226198 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Gm28979-201ENSMUST00000190949 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms