Protein–RNA interactions for Protein: O35609

Scamp3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp3O35609 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms