Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk4O35493 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk4O35493 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk4O35493 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk4O35493 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Clk4O35493 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clk4O35493 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk4O35493 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clk4O35493 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Clk4O35493 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk4O35493 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Clk4O35493 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk4O35493 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk4O35493 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk4O35493 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Clk4O35493 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk4O35493 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk4O35493 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk4O35493 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk4O35493 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk4O35493 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clk4O35493 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk4O35493 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk4O35493 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Clk4O35493 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clk4O35493 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk4O35493 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk4O35493 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk4O35493 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk4O35493 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clk4O35493 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk4O35493 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk4O35493 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk4O35493 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk4O35493 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk4O35493 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Clk4O35493 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk4O35493 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk4O35493 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clk4O35493 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Clk4O35493 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk4O35493 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Clk4O35493 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clk4O35493 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clk4O35493 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk4O35493 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk4O35493 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk4O35493 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk4O35493 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk4O35493 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk4O35493 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk4O35493 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clk4O35493 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms