Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms