Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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