Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NmiO35309 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NmiO35309 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NmiO35309 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NmiO35309 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NmiO35309 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NmiO35309 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NmiO35309 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NmiO35309 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NmiO35309 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NmiO35309 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NmiO35309 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NmiO35309 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NmiO35309 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NmiO35309 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NmiO35309 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NmiO35309 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NmiO35309 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NmiO35309 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NmiO35309 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NmiO35309 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NmiO35309 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NmiO35309 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NmiO35309 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NmiO35309 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NmiO35309 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NmiO35309 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NmiO35309 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NmiO35309 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NmiO35309 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NmiO35309 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NmiO35309 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NmiO35309 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NmiO35309 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NmiO35309 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NmiO35309 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NmiO35309 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NmiO35309 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NmiO35309 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NmiO35309 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NmiO35309 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NmiO35309 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NmiO35309 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NmiO35309 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NmiO35309 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NmiO35309 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NmiO35309 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NmiO35309 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NmiO35309 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NmiO35309 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NmiO35309 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NmiO35309 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NmiO35309 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NmiO35309 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NmiO35309 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NmiO35309 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NmiO35309 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NmiO35309 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NmiO35309 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NmiO35309 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NmiO35309 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NmiO35309 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NmiO35309 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NmiO35309 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NmiO35309 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NmiO35309 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NmiO35309 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NmiO35309 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NmiO35309 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NmiO35309 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NmiO35309 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NmiO35309 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NmiO35309 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NmiO35309 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NmiO35309 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NmiO35309 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NmiO35309 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NmiO35309 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NmiO35309 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NmiO35309 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NmiO35309 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NmiO35309 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NmiO35309 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NmiO35309 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NmiO35309 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NmiO35309 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NmiO35309 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NmiO35309 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NmiO35309 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NmiO35309 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NmiO35309 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NmiO35309 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NmiO35309 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NmiO35309 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NmiO35309 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NmiO35309 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NmiO35309 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NmiO35309 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NmiO35309 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NmiO35309 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms