Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms