Protein–RNA interactions for Protein: O08583

Alyref, THO complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlyrefO08583 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AlyrefO08583 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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