Protein–RNA interactions for Protein: O08546

U90926, Putative TNF-resistance related protein, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U90926O08546 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
U90926O08546 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
U90926O08546 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
U90926O08546 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
U90926O08546 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
U90926O08546 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
U90926O08546 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
U90926O08546 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
U90926O08546 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
U90926O08546 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
U90926O08546 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
U90926O08546 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
U90926O08546 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
U90926O08546 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
U90926O08546 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
U90926O08546 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
U90926O08546 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
U90926O08546 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
U90926O08546 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
U90926O08546 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
U90926O08546 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
U90926O08546 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
U90926O08546 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
U90926O08546 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
U90926O08546 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
U90926O08546 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
U90926O08546 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
U90926O08546 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
U90926O08546 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
U90926O08546 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
U90926O08546 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
U90926O08546 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
U90926O08546 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
U90926O08546 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
U90926O08546 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
U90926O08546 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
U90926O08546 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
U90926O08546 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
U90926O08546 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
U90926O08546 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
U90926O08546 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
U90926O08546 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
U90926O08546 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
U90926O08546 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
U90926O08546 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
U90926O08546 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
U90926O08546 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
U90926O08546 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
U90926O08546 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
U90926O08546 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
U90926O08546 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
U90926O08546 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
U90926O08546 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
U90926O08546 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
U90926O08546 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
U90926O08546 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
U90926O08546 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
U90926O08546 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
U90926O08546 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
U90926O08546 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
U90926O08546 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
U90926O08546 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
U90926O08546 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
U90926O08546 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
U90926O08546 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
U90926O08546 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
U90926O08546 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
U90926O08546 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
U90926O08546 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
U90926O08546 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
U90926O08546 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
U90926O08546 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
U90926O08546 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
U90926O08546 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
U90926O08546 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
U90926O08546 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
U90926O08546 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
U90926O08546 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
U90926O08546 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
U90926O08546 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
U90926O08546 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
U90926O08546 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
U90926O08546 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
U90926O08546 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
U90926O08546 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
U90926O08546 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
U90926O08546 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
U90926O08546 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
U90926O08546 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
U90926O08546 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
U90926O08546 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
U90926O08546 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
U90926O08546 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
U90926O08546 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
U90926O08546 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
U90926O08546 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
U90926O08546 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
U90926O08546 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
U90926O08546 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
U90926O08546 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms