Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MsmbO08540 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MsmbO08540 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
MsmbO08540 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
MsmbO08540 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MsmbO08540 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MsmbO08540 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MsmbO08540 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MsmbO08540 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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