Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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