Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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