Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP9

Fam240a, Family with sequence similarity 240 member A, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam240aJ3QNP9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Fam240aJ3QNP9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Fam240aJ3QNP9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Fam240aJ3QNP9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam240aJ3QNP9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Fam240aJ3QNP9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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