Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm21972J3QN38 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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