Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms