Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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