Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms