Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G2

Usp17ld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein D, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17ldG5E8G2 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp17ldG5E8G2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp17ldG5E8G2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp17ldG5E8G2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp17ldG5E8G2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp17ldG5E8G2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp17ldG5E8G2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp17ldG5E8G2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp17ldG5E8G2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp17ldG5E8G2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp17ldG5E8G2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp17ldG5E8G2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp17ldG5E8G2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp17ldG5E8G2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp17ldG5E8G2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp17ldG5E8G2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp17ldG5E8G2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms