Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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