Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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