Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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