Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms