Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms