Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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