Protein–RNA interactions for Protein: E9PWQ3

Col6a3, Collagen, type VI, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 3,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a3E9PWQ3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a3E9PWQ3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms