Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms