Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

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Length 138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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BC035044E0CXF8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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