Protein–RNA interactions for Protein: D3Z741

4930444G20Rik, RIKEN cDNA 4930444G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444G20RikD3Z741 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930444G20RikD3Z741 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms