Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms