Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms