Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Phf11bB4XVQ1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Phf11bB4XVQ1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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Phf11bB4XVQ1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Phf11bB4XVQ1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Phf11bB4XVQ1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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