Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AU015836B2RUM3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AU015836B2RUM3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AU015836B2RUM3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AU015836B2RUM3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AU015836B2RUM3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AU015836B2RUM3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AU015836B2RUM3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AU015836B2RUM3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AU015836B2RUM3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AU015836B2RUM3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AU015836B2RUM3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AU015836B2RUM3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AU015836B2RUM3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AU015836B2RUM3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AU015836B2RUM3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AU015836B2RUM3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AU015836B2RUM3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AU015836B2RUM3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
AU015836B2RUM3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AU015836B2RUM3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AU015836B2RUM3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AU015836B2RUM3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AU015836B2RUM3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AU015836B2RUM3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AU015836B2RUM3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AU015836B2RUM3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AU015836B2RUM3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AU015836B2RUM3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AU015836B2RUM3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AU015836B2RUM3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AU015836B2RUM3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AU015836B2RUM3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AU015836B2RUM3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
AU015836B2RUM3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AU015836B2RUM3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AU015836B2RUM3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AU015836B2RUM3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AU015836B2RUM3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AU015836B2RUM3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AU015836B2RUM3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AU015836B2RUM3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AU015836B2RUM3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AU015836B2RUM3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AU015836B2RUM3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms