Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms