Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apol7aB2RT54 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Apol7aB2RT54 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Apol7aB2RT54 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Apol7aB2RT54 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms