Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms