Protein–RNA interactions for Protein: A2AQH1

Cerkl, Ceramide kinase-like, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CerklA2AQH1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CerklA2AQH1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CerklA2AQH1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CerklA2AQH1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CerklA2AQH1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CerklA2AQH1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CerklA2AQH1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CerklA2AQH1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CerklA2AQH1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CerklA2AQH1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CerklA2AQH1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CerklA2AQH1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CerklA2AQH1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CerklA2AQH1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CerklA2AQH1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CerklA2AQH1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CerklA2AQH1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CerklA2AQH1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CerklA2AQH1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CerklA2AQH1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CerklA2AQH1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CerklA2AQH1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CerklA2AQH1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CerklA2AQH1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CerklA2AQH1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CerklA2AQH1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CerklA2AQH1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CerklA2AQH1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CerklA2AQH1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CerklA2AQH1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CerklA2AQH1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CerklA2AQH1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CerklA2AQH1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CerklA2AQH1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CerklA2AQH1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CerklA2AQH1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CerklA2AQH1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CerklA2AQH1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CerklA2AQH1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms