Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms