Protein–RNA interactions for Protein: A2A9C3

Szt2, KICSTOR complex protein SZT2, mousemouse

Predictions only

Length 3,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szt2A2A9C3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms