Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms