Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSB3

Gm3880, Predicted pseudogene 3880, mousemouse

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Length 72 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3880A0A1B0GSB3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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