Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2LB96

Trbv29, T cell receptor beta, variable 29 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv29A0A0G2LB96 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms