Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms