Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm17190V9GX38 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm17190V9GX38 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm17190V9GX38 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm17190V9GX38 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm17190V9GX38 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm17190V9GX38 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm17190V9GX38 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm17190V9GX38 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm17190V9GX38 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm17190V9GX38 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm17190V9GX38 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
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