Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms